El Colegio Bautista de Caguas cuenta con 2 acreditaciones de agencias muy reconocidas como Comisión Acreditadora de Instituciones Educativas (CADIE) y Middle States Association (MSA). Estas distinciones certifican que la institución cuenta con excelencia en sus procesos académicos y formación integral de sus estudiantes. Además, ofrece la confianza de que existe un mejoramiento continuo para mantener esa excelencia académica y aumenta el reconocimiento público de la institución.

Certificación Departamento de Estado

Anualmente las escuelas de educación básica tienen que registrarse y licenciarse en el Departamento de Estado (antes proceso Consejo de Educación) según dispone la ley núm. 212 de 12 de Agosto de 2018, conocida como la Ley de Registro y Licenciamiento de Instituciones Educativas. Este registro tiene

como requisito primordial estar acreditado. El Colegio Bautista de Caguas cuenta con todos los requisitos establecidos, por lo que obtiene esta certificación y licencia.